Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NhsB1AV60 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NhsB1AV60 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms