Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl2A2ARM1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms