Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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