Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn1aA2APX8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms