Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms