Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramel3A2AHA7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms