Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calcoco2A2A6M5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms