Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5538W4VSP6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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