Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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