Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stk39Q9Z1W9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms