Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmg20bQ9Z104 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hmg20bQ9Z104 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms