Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms