Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn3Q9WUK7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms