Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed2Q9R0Q3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed2Q9R0Q3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms