Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrkQ9R0G8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrkQ9R0G8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms