Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plod3Q9R0E1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms