Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms