Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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