Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PnckQ9QYK9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PnckQ9QYK9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PnckQ9QYK9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PnckQ9QYK9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PnckQ9QYK9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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