Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx4Q9QY61 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx4Q9QY61 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms