Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pkp3Q9QY23 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pkp3Q9QY23 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pkp3Q9QY23 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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