Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChmQ9QXG2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms