Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tcea2Q9QVN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms