Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkap1Q9JMB0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkap1Q9JMB0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms