Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod4Q9JLH8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod4Q9JLH8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tmod4Q9JLH8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tmod4Q9JLH8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tmod4Q9JLH8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tmod4Q9JLH8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tmod4Q9JLH8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmod4Q9JLH8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod4Q9JLH8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms