Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms