Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnot9Q9JKY0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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