Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ldb3Q9JKS4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ldb3Q9JKS4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms