Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod2Q9JKK7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Tmod2Q9JKK7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Tmod2Q9JKK7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod2Q9JKK7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Tmod2Q9JKK7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod2Q9JKK7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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