Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl39Q9JKF7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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