Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms