Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Uchl3Q9JKB1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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