Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnq4Q9JK97 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnq4Q9JK97 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnq4Q9JK97 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnq4Q9JK97 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnq4Q9JK97 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnq4Q9JK97 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnq4Q9JK97 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnq4Q9JK97 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnq4Q9JK97 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnq4Q9JK97 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnq4Q9JK97 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnq4Q9JK97 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Kcnq4Q9JK97 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms