Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard6bQ9JK83 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms