Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnga3Q9JJZ8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms