Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smad9Q9JIW5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smad9Q9JIW5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smad9Q9JIW5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms