Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx21Q9JIK5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx21Q9JIK5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx21Q9JIK5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms