Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm9sf3Q9ET30 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms