Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rtn3Q9ES97 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtn3Q9ES97 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms