Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp29Q9ES63 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp29Q9ES63 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp29Q9ES63 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp29Q9ES63 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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