Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trhr2Q9ERT2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trhr2Q9ERT2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms