Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms