Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ropn1lQ9EQ00 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms