Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc1Q9EP53 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms