Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt112Q9DCG9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms