Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms