Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph3bQ9DA80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms