Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc89Q9DA73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms