Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms