Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgf29Q9DA08 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms